Nova različica virusa SARS-CoV-2

Sodelavec projekta odprte znanost COVID.SI Sebastian Pleško je s pomočjo analize sekvenc proteina S virusa SARS-CoV-2  objavljenih v podatkovni zbirki GISAID ( https://www.gisaid.org/ ), prišel do zaključka, da  se je zgodila spontana mutacija različice virusa B.1.258.17, ki je zastopana v Sloveniji. Omenjena različica virusa, ki je povzročila precej okužb zaznanih v Sloveniji in Češkem tekom drugega vala, se sedaj širi tudi v BIH in na Hrvaškem. Različica virusa je imela že prej mutacijo špičk N439K (na RBD) in L189F, 69_70 del (na NTD), ki jo je naredila bolj kužno in bolj rezistentno na protitelesa, je sedaj pridobila še mutacijo značilno za Britansko različico B.1.1.7: N501Y, ki se pojavlja tudi v Brazilski P.1. in J. Afriški B.1.351, ki povzroča višjo kužnost, predvsem na času trajanja kužnosti ter tudi pripomore k rezistentnosti na protitelesa.

Virus SARS-CoV-2 je RNA virus za katerega so značilne pogoste mutacije, ki se dogajajo povsem spontano. Nevarne, bolj kužne mutacije, seveda niso regionalno omejene, spontano se lahko pojavijo kjerkoli in kadarkoli. Pogostost  različic virusa SARS-CoV-2 od začetka prvega vala pa do današnjega dne je prikazana na Sliki 1.  Različica B.1.258.17 je obarvana vijolično.

4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3B.1 B B.29 B.1.1 B.1.1.70 B.1.1.1 B.1.258 B.1.149 B.1.160 B.1.258.17 B.1.1.7 Drugi

SLIKA 1: Različice virusa SARS-CoV-2 v Sloveniji tekom mesecev. Vir podatkov: GISAID, Barvna paleta: ColorBrewer2. Generirano: 26.03.2021, Avtor: S.P.@covid.si

Socialna distanca in temeljita osebna higijena so še vedno priporočila, ki najbolj omejujejo širjenje  virusa. Pomembno pa je tudi to, da se v čim večji meri cepimo in na tak način zavarujemo sebe in vse, ki jih imamo radi.